기계적, 물리적 또는 생물적(발효, 훈제 등) 제조·가공법을 사용하여야 하고, 식품첨가물을 최소량 사용해야 한다.

유기가공식품과 비유기가공식품을 절대로 동일한 설비로 가공하여서는 아니 된다.

유기가공식품을 제조·가공하기 전에 비유기 가공식품을 제조·가공한 때에는 그 제조설비를 철저히 세척해야 한다.

유기가공식품과 원료유기농산물은 비유기 가공식품 및 비유기원료농산물과 따로 보관·저장하여야 한다.