질소를 고정하는 미생물을 공생적 질소고정작용을 하는 뿌리혹박테리아(Rhizobium)가 있다.

무기질소는 유기질소 형태로 결합된 후 단백질이나 핵산을 거쳐서 노폐물이나 혹은 생물체의 원형질 형태로 되돌아 온다.

종속영양미생물은 유기질소를 이화하게 되며 이때 무기질소인 질산성질소 형태로 변형되어 발효된다.

질산화미생물은 화학합성을 하는 독립영양미생물이다.