채취용기는 시료를 채우기 전에 깨끗한 물로 3회 이상 씻은 다음 사용한다.

유류 또는 부유물질 등이 함유된 시료는 시료의 균일성이 유지될 수 있도록 채취하여야 하며 침전물 등이 부상하여 혼입되어서는 안된다.

용존가스, 환원성 물질, 휘발성유기화합물, 냄새, 유류 및 수소이온 등을 측정하는 시료는 시료용기에 가득 채워야 한다.

시료 채취량은 보통 3∼5L 정도이어야 한다.