다핵, 비운동성, 비광합성이며 세포벽이 뚜렷한 특징이 있다.

많은 원생동물은 녹조류가 진화과정에서 단지 엽록소를 상실함으로써 생긴 것으로 추측할 수 있다.

대게 호기성으로 크기가 100μm 이내의 것이 많으며 용해성 유기물 또는 세균 등을 섭취한다.

원생동물은 위족류, 편모충류, 섬모충류 등으로 나눌 수 있다.