시료채취용기는 시료를 채우기 전에 시료로 3회 이상 씻은 다음 사용한다.

유류 또는 부유물질 등이 함유된 시료는 균질성이 유지될 수 있도록 채취하여야 하며 침전물 등이 부상 하여 혼입되어서는 안 된다.

심부층의 지하수 채취시에는 고속양수펌프를 이용하여 채취시간을 최소화함으로서 수질의 변질을 방지하여야 한다.

용존가스, 환원성 물질, 휘발성유기화합물, 냄새, 유류 및 수소이온 등을 측정하기 위한 시료를 채취할때는 운반 중 공기와의 접촉이 없도록 시료 용기에 가득 채운 후 빠르게 뚜껑을 닫는다.