황산이온은 자연수 속에 들어 있는 주요 음이온이다.

용존산소와 질산염이 존재하지 않는 환경에서 황산이온은 수소원(전자공여체)으로 사용된다.

황산이온이 과다하게 포함된 수돗물을 마시면 설사를 일으킨다.

황산이온이 혐기성 상태에서 환원되어 생성되는 황화수소로 인하여 악취문제가 발생한다.