소화는 유기산 생성, 메탄 생성 독립영양미생물 2가지그룹의 미생물에 의해 이루어진다.

메탄형성 미생물은 산형성 미생물보다 느리게 성장하고 약 6.7~7.4정도의 좁은 pH법위를 가진다.

혐기성 소화 동안의 미생물 작용은 고형물의 액화, 용해성 고형물의 소화, 가스생성의 3가지 단계로 구성된다.

적절히 운전되는 소화조에서의 생성가스는 주로 메탄과 이산화탄소는 가스로 구성된다.