고농도의 TDS(50000 mg/L 이상)를 포함한 침출수는 생물학적 처리가 곤란하다.

많은 생물학적 처리시설에 있어서는 중금속의 독성이 문제가 되기도 한다.

황화물의 농도가 높으면 혐기성 처리 시 악취 문제가 발생할 수 있다.

높은 COD의 침출수는 호기성 처리하는 것이 혐기성 처리보다 경제적이다.