자분탐상시험은 표면 및 표면직하의 결함이 검출가능한 것에 대해, 침투탐상시험은 표면에 열려져 있는 결함만이 검출 가능하다.

표면결함의 개구부가 찌부러져 있으면 자분탐상시험에서는 결함의 검출정도가 크게 저하 또는 검출 불가능하게 되는 경우가 있다.

결함의 내부에 물이나 유지류 또는 비금속 개재물 등의 이물질이 존재하는 경우에도 침투탐상시험에서는 그 영향이 거의 없다.

핀홀과 같은 원형형태의 표면 결함검출에는 자분탐상시험의 경우가 침투탐상시험보다도 우수하다.