깊은 수층과 오염운을 가진 부지에는 부적합하다.

오염물의 처리지대로 이동시켜야 하므로 운영, 유지비가 대부분의 저감 기법들보다 많이 소요된다.

오염물질이 복합적으로 존재하는 침출수의 경우는 하나의 반응물질만으로 처리하기에는 효율이 높지 않다.

투수성 반응벽은 오염된 지하수를 복원하기 위해 반응기질로 채워진 지중벽체이다.