유전자 간의 방향을 알 수 있기 때문에 규모를 결정할 수 있다.

선발을 위한 최소 집단의 규모를 걸정할 수 있다.

유전자 간의 거리를 알 수 있어 잡종강세를 예측할 수 있다.

유전자 간의 연관관계를 구명하여 교잡종 생산에 유리하다.