순계분리법은 타가수정 작물에서는 순계가 이루어지지 않아서 적용될 수 없다.

완전한 순계 내에서는 선발의 효과가 없다.

순계설을 이용한 순계분리법은 주로 자가수정 작물에 대하여 행한다.

기본집단에는 유전자형을 달리한 많은 순계가 혼합되어 있다.