분석종으로는 게놈을 아직 모르는 이배체를 사용한다.

근연종이 가지는 게놈 간의 친화력을 조사한다.

여러 개의 분석종과 교배함으로써 게놈을 정확히 알 수 있다.

F1 식물의 성숙분열에 있어서 염색체의 접합 여부로 분석한다.