상호대립억제작용은 잡초 방제에 방해가 된다.

식물 병원균은 수생 잡초의 방제에 효과적이다.

잡초 방제에 이용되는 천적은 식해성 곤충일수록 좋다.

어패류를 이용할 경우 초종 선택성이 없어 방류제한성이 문제가 된다.