단교잡 품종은 복교잡 품종에 비해 품종의 균일도가 낮다.

단교잡 품종의 복교잡 품종에 비해 채종 비용이 많이 든다.

복교잡 품종은 단교잡 품종보다 채종 체계가 복잡하다.

복교잡 품종이 실용화되고 있는 대표적 작물은 사료용 옥수수이다.