저장고의 상대습도는 종자내의 수분 함량이 좌우한다.

습도가 높으면 저장고 내의 병해충의 발생을 촉진하여 종자의 퇴화를 촉진하게 된다.

습도가 높으면 상대적으로 온도가 낮아진다.

수분함량이 많은 종자는 저장고의 상대습도가 낮은 곳에 저장하는 경우 종자의 무게가 감소한다.