바이러스는 세포벽이 있으나 파이토플라스마는 세포벽이 없다.

바이러스는 RNA를 함유하고 있으나 파이토플라스마는 RNA가 없다.

바이러스는 매개충이 옮겨 주나 파이토플라스마는 매개충에 의하여 전파되지 않는다.

바이러스는 테트라싸이클린(tetracycline)에 대하여 저항성이나 파이토플라스마는 감수성이다.