담수상태의 논토양에서는 토층분화가 일어나고 미생물에 의해 탈질현상이 생긴다.

논토양이 담수로 인해 환원상태가 되면 인산의 무효화가 발생한다.

논토양이 담수되면 조류의 대기질소 고정작용이 나타난다.

토양이 건조하였다가 가수하면 건토효과등에 의해 유기태질소의 무기화가 촉진된다.