유기생산시스템에서 토양비옥화, 병해충방제, 축산물 품질향상, 유기식품가공을 위한 모든 자재는 각국에서 정하는 관련규정에 따라야 한다.

각국의 인증기관 또는 관계당국은 특정자재의 사용량, 사용횟수, 구체적 사용목적을 정할 수 있다.

일차생산을 위해 필요한 허용자재는 오용되지 않도록 주의해서 사용한다.

코덱스 가이드라인에 의한 허용물질 기준은 각국이 변경할 수 없는 최종적 규제수단이다.