기계적, 물리적 또는 화학적(분해, 합성 등) 제조·가공방법을 사용하여야 하고, 식품 첨가물을 최소량 사용하여야 한다.

유기가공식품과 비 유기가공식품을 동일한 시간에 동일한 설비로 제조·가공하지 않는다.

유기가공식품을 제조·가공하기 전에 비 유기가공식품을 제조·가공한 때에는 제조 설비의 이물질을 제거하고 세척 등을 철저히 하여야 한다.

유기가공식품과 원료 유기농산물은 비유기 가공식품 및 비유기 원료 농산물과 따로 보관·저장해야 한다.