종자전염으로는 줄무늬잎마름병, 오갈병 등이 있으며 유기농업자재 등을 이용하여 소독을 철저히 해야 한다.

잎집무늬마름병은 써레질 직후 논 수면에 떠있는 균핵을 제거하고 밀식을 자제하여 포기사이로 통풍이 잘되도록 한다.

줄무늬잎마름병과 검은줄오갈병은 애멸구에 의해 매개되는 바이러스병으로 애멸구의 월동처인 월동잡초를 제거한다.

추락답에서 많이 발생하는 깨씨무늬병은 종자소독을 철저히 하고 객토, 유기물 시용 등으로 지력을 높이도록 한다.