종묘채종원은 차대검정을 별도로 실시해야 한다.

종묘채종원은 채종원 내 유전자의 폭을 넓히는 데 유리하다.

클론채종원은 한 번 조성하여 2세대 이상의 선발이 가능하다.

클론 채종원은 서로 친척 관계에 있는 나무들 간에 교배될 가능성이 높다.