MCE 막여과지는 원료인 셀룰로스가 수분을 흡수하지 않으므로 정확성을 요구하는 중량분석에 사용된다.

MCE 막여과지는 산에 쉽게 용해되므로 입자상물질 중의 금속을 채취하여 원자흡광법으로 분석하는데 적정하다.

산업위생에서는 거의 대부분이 직경 37mm, 구멍의 크기 0.8㎛의 MCE 막여과지를 사용하고 있다.

시료가 여과지의 표면 또는 표면 가까운 곳에 침착되므로 석면, 유리섬유 등 현미경분석을 위한 시료 채취에도 이용된다.