환경공해가 감소되어 CO₂ 발생이 전혀 없다.

연료전지를 이용한 발전시스템에서 연료전지는 발전효율이 40∼60% 정도이며, 열병합발전할 경우에는 80% 이상 가능하다.

회전부위가 없어 소음이 매우 낮고, 다량의 냉각수가 불필요하다.

도심 부근의 설치가 가능하여 송배전시설비 및 전력손실이 적은 편이다.