토양의 물리적 성질과 발병과는 전혀 상관관계가 없다.

콩깍지 등 미분해 유기물을 토양에 첨가해 주면 발병율을 낮출 수 있다.

소나무류 묘목의 모잘록병은 중성~알카리성 토양에서는 잘 발생하지 않는다.

토양이 너무 습하거나 건조하지 않게 배수관리를 잘 해주는 것도 발병율을 낮출 수 있는 방제 방법이다.