보전생물학은 개별 종 또는 개체군의 복원에, 복원생태학은 장기적인 생태계의 기능회복에 관심을 갖는다.

보전생물학은 유전자 또는 개체군이, 복원생태학은 군집 또는 생태계가 연구대상이다.

보전생물학은 서술적, 이론적인, 복원생태학은 실험적 접근방법을 이용한다.

복원을 위한 주요 개념으로 보전생물학은 극상을, 복원생태학은 천이를 사용한다.