비오톱 내 전형적인 종의 유전자 흐름을 일시적으로라도 문제가 없어지도록 하려면 비오톱의 수가 적을수록 유리하여 공간적으로 충분한 거리를 유지하는 것이 좋다.

비오톱의 최소면적은 단위면적당 서식지와 구조의 다양성에 크게 좌우되기 때문에 면적은 가장 큰 공간의 면적으로 설정한다.

지표성의 원칙이란 각 비오톱 타입에서 면적에 관한 요구가 가장 높은 종 개체군의 휴지에 필요한 면적을 구하여, 이 값을 그 비오톱타입이 최소 필요 면적의 기준치로 정하는 것이다.

비오톱의 연결성을 확보하기 위해 징검돌(stepping stone) 비오톱이 매우 유용하므로 물리적으로 선형 또는 대형의 연결을 꾀하기보다는 징검돌형 비오톱을 확보하는 것이 바람직하다.