단어별 검색엔진은 하나의 데이터베이스에 모든 데이터를 저장하고 특정 검색단어를 입력하여 원하는 정보를 찾는 방법으로 야후가 여기에 속한다.

주제별 검색엔진은 정보를 주제별로 분류하여 데이터베이스에 저장하여 분류 정도만 알아도 찾을 수 있도록 한 방법으로 라이코스가 여기에 속한다.

주제별 검색엔진은 찾고자 하는 정보의 분류만 알아도 찾을 수 있으나, 여러 단계를 거쳐야 한다는 단점이 있다.

단어별 검색엔진은 검색어로 신속히 찾을 수 있으나, 데이터베이스에 색인을 저장하지 않고 모든 데이터를 저장해야 하는 단점이 있다.