양식장을 옮기거나, 양식 대상종을 피난시킨다.

화학약품 등을 사용하여 적조생물이 발생하기 시작하는 초기에 제거한다.

해저의 오염된 개흙을 미리 제거해 준다.

질소나 인 등이 수역 내에 유입되는 양을 줄인다.